活動
論文・登壇・ソフトウェア成果物・プレスリリースを、公開情報の記録としてまとめています。
論文
- Development of the Cell-IO database integrating cellular-level functions and phenotypes with single-cell gene expression data [採録済]
細胞機能・表現型と1細胞遺伝子発現データを統合したデータベース「Cell-IO」の開発。IIBMP2026 ポスター P1-40。
- Creating an engine of scientific discovery, an Indo-Japan perspective: learnings from IJNTC 2025 workshop
SBI（Systems Biology Institute）主導の印日ワークショップ IJNTC 2025 の学びをまとめた論文。Nobel Turing Challenge 系の「科学的発見エンジン」構想。
- Survey on large language model annotation of cellular senescence from figures in review articles
レビュー論文中の図から細胞老化に関する記述を大規模言語モデルでアノテーションする調査。
- open-japanese-mesh: assigning MeSH UIDs to Japanese medical terms via open Japanese-English glossaries
公開の日英対訳用語集を用いて日本語医学用語に MeSH UID を付与する手法。
登壇・発表
- LA-Bench 2025 実験手順生成AIコンペティション 開催報告＆表彰
LA-Bench 2025の開催成果、評価設計、参加・採点結果を報告。2025年度人工知能学会コンペティション開催支援制度の支援を受けた取り組み。
- テカン Cavro Omni Flex を用いた実験ロボット AI エージェントのデモ
テカン液体分注ロボット Cavro Omni Flex を用いた段階希釈デモを発表。
- 「AI for 心理学」のすすめ——その研究、AIがちょっと手伝います
日本心理学会 JPA2025 のシンポジウム。山田涼太は話題提供者として登壇。
- ロボット実験にふさわしい実験プロトコルのありかた
実験プロトコルの機械可読化（論文本文の NLP 構造化・固有表現抽出・関係抽出・オントロジー）とロボット実験への道筋。
ソフトウェア・成果物
- LA-Bench（Laboratory Automation Benchmark）
実験手順生成タスクのためのベンチマークデータセット開発プロジェクトを主導。2025年度人工知能学会コンペティション開催支援制度の支援を受け、LA-Bench 2025を実施。
- LabCode（自動実験プロトコル言語プラットフォーム）
自動実験プロトコル言語プラットフォーム LabCode の開発に参加。Web UI・ログサーバー・シミュレーターなど4つの公開リポジトリで構成。
- NANDO（Nanbyo Disease Ontology）
難病オントロジー NANDO の変換パイプライン開発と、description／obsoleteを含む出力整備に貢献。成果は NanbyoData で継続提供・更新。
プレスリリース
- Science Aid、テカンジャパンの協力のもと、自然言語で実験ロボットを操作する AI エージェントの開発に着手
テカン液体分注ロボット「Cavro Omni Flex」を対象に、自然言語指示をロボット操作指令へ変換・実行するシステムを構築。
- Science Aid株式会社、京都大学医学研究科 奥野研究室と共同で創薬AIエージェント開発を開始
公共DB（UniProt・ChEMBL・PDB・AlphaFold DB）・文献を横断解析し、標的機能関係／立体構造解析／創薬計算ストラテジー提案を自動生成。
- fuku株式会社、AI for Science 推進に伴い「Science Aid株式会社」へ社名変更
事業領域の拡大（創薬・バイオから食品・農業を含む広範な科学研究へ）に伴う社名変更。
- ライフサイエンス研究支援サービス『Sophiscope』オープンβ版提供開始
論文を自然言語処理・機械学習で構造化し、実験条件を統一フォーマットへ整理して先行研究を横断比較。