2018年10月3日 / 最終更新日時 : 2019年2月5日 roy29fuku 論文解析 科学論文解析リソースまとめ 生命科学の論文から機械可読な動物実験プロトコルを抽出して、実験の効率化をめざしています。 興味のある方はTwitterでご連絡ください。 ここでは特にライフサイエンスの論文を解析するのに使えそうなデータセットや訓練済みの […]
2018年10月2日 / 最終更新日時 : 2018年10月2日 roy29fuku 論文解析 SCIERC：科学論文の情報抽出データセットをbratで眺める 科学論文のテキストにentity, relationをアノテーションしたデータセットです。 coreferenceも考慮しているので複数文をまたがるentityにもリンクが貼られています。 科学論文からknowledge […]
2018年10月2日 / 最終更新日時 : 2018年10月2日 roy29fuku 論文解析 EXACT2：生命科学の実験プロトコル用オントロジー 生命科学実験の自動化や再現性担保のためにプロトコルを機械可読にすることは大いに意義があります。 しかし現在多くの実験プロトコルは自然言語による自由記述でコンピュータにとっては扱いづらい形式です。 EXACT2は実験プロト […]
2018年9月29日 / 最終更新日時 : 2018年12月19日 roy29fuku 自然言語処理 macOSでBratを使う 以前生命科学論文のアノテーション済み公開データを使って薬剤のNamed Entity Recognitionをやりました。 Relation Extractionを試みるにあたって自分でアノテーションをやることにしました […]
2018年8月29日 / 最終更新日時 : 2018年8月29日 roy29fuku 自然言語処理 NLP若手の会のハッカソンで賞をもらった話 ACL、NIPSの論文を国別でフィルタリングするサイトを作りました。 参加経緯 東大のアントレプレナーシップ関連で知り合いになった自然言語処理の博士の方に、NLP若手の会なるものがあると教えてもらいました。 […]
2018年8月24日 / 最終更新日時 : 2019年3月18日 roy29fuku 自然言語処理 BioCreative IVまとめ バイオ領域でのNLPをやるにあたってとても参考にしているので、まとめました。 BioCreativeとは Critical Assessment of Information Extraction systems in […]
2018年7月26日 / 最終更新日時 : 2018年7月26日 roy29fuku 言語資源 言語資源とは 言語資源とは 言語のデータセット。 自分で作るのは大変なので既存のものを利用するのが吉。 単語などの言語資源である辞書や、文章の言語資源であるコーパスなどの総称。 まずは辞書とコーパスを理解すれば良いと思います。 &nb […]
2018年6月12日 / 最終更新日時 : 2019年4月6日 roy29fuku 自然言語処理 PyTorch DL for NLP -Bi-LSTM CRF- 前回はLSTMを使ってPOS tagging（品詞タグ付け）を行いました。 PyTorch DL for NLP -LSTM- 今回は応用編として、bidirectional LSTMとCRFを組み合わせたモデルを使 […]
2018年6月9日 / 最終更新日時 : 2018年7月26日 roy29fuku 自然言語処理 PyTorch DL for NLP -LSTM- 前回は単語埋め込み（分散表現）を利用してn-gramやCBOWを用いて単語の予測を行いました。 PyTorch DL for NLP -bag of wordsで英語とスペイン語を分類- 今回は公式の以下チ […]
2018年6月5日 / 最終更新日時 : 2018年7月26日 roy29fuku 自然言語処理 PyTorch DL for NLP -bag of wordsで英語とスペイン語を分類- 前回、DL for NLPを見据えてPyTorchの概要に触れました。 PyTorch DL for NLP -イントロダクション- 今回は公式の「Deep Learning with PyTorch」に沿 […]
